Karl Durst wurde zunächst im Gefängnis Stuttgart, dann bis zum Prozessbeginn in Berlin-Moabit inhaftiert. Am 12. Oktober 1938 wurde er zusammen mit dem Schweizer Ernst Bärtschi aus Kreuzlingen und Andreas Fleig – ein deutscher Staatsbürger, der in unmittelbarer Nachbarschaft zu Ernst Bärtschi in Kreuzlingen/CH wohnte – vom Oberreichsanwalt beim Volksgerichtshof in Berlin angeklagt. Die Anklage warf den Angeklagten vor, „in Konstanz und an anderen Orten des Reiches seit dem Sommer 1933 bis zu ihrer Festnahme fortgesetzt und gemeinschaftlich miteinander und mit anderen das hochverräterische Unternehmen, die Verfassung des Reichs mit Gewalt zu ändern, vorbereitet zu haben„. Konkret lautete der Vorwurf, die drei hätten Schriften aus der Schweiz nach Deutschland eingeführt und sich für die „hochverräterischen Bestrebungen der SPD eingesetzt„. Außerdem seien sie als Verbindungsleute zwischen geflüchteten deutschen Gewerkschaftsfunktionären in der Schweiz tätig gewesen. Weiter warf die Anklage ihm vor, mehrere Personen mit gefälschten Papieren in die Schweiz gebracht zu haben.
Am 12. Oktober 1938 wurde Karl Durst zu acht Jahren Zuchthaus und acht Jahren Ehrverlust, d.h. Aberkennung seiner bürgerlichen Rechte, verurteilt. Seine Mitangeklagten Ernst Bärtschi und Andreas Fleig erhielten 13 bzw. 15 Jahre Zuchthaus.
Nach seiner Verurteilung wurde Durst über Ludwigsburg und Hamm am 25. Mai 1939 in das Lager II Aschendorfermoor (bei Papenburg im Emsland) eingeliefert, das von der SA-Standarte 10 unter ihrem Anführer SA-Oberführer Werner Schäfer bewacht wurde. Die Arbeitszeit der Strafgefangenen bei der Moorarbeit betrug 12 Stunden. Daneben stand die so genannte körperliche Ertüchtigung auf dem Programm. „Im Moor stundenlanger Sport bis zur Erschöpfung unter Schlägen und Gummiknütteln und Fußtritten„, so beschreibt Durst diesen Teil des Lageralltags.
Am 1. Dezember 1940 erfolgte die Verlegung in das Arbeitslager 1, im heutigen Rodgau bei Dieburg in Hessen. Dieses Lager unterstand der NS-Justizverwaltung, Staatsanwaltschaft Darmstadt, es war also kein Konzentrationslager oder Zuchthaus.
Das Lager wurde zunächst für die Flurbereinigung von fast 40 Gemeinden der Kreise Dieburg und Offenbach eingerichtet. Mit Kriegsbeginn wurden die Gefangenen jedoch meist von den Erschließungsarbeiten abgezogen und in der Rüstungsproduktion, als Hilfskräfte in der Landwirtschaft, zum Beseitigen von Kriegsschäden, Reparaturarbeiten für die Reichsbahn oder zum Bombenräumen eingesetzt.
Die Gefangenen wurden im Lager relativ human und korrekt behandelt. Diesen Umstand verdankten sie dem Lagerleiter Franz Mohr, der aus dem badischen Polizeidienst kam. Mohr hatte Kontakte zum Widerstandskreis um den ehemaligen Leipziger Oberbürgermeister Carl Goerdeler und war in die Pläne der Verschwörer zur Beseitigung Hitlers eingeweiht. Seine ablehnende Haltung zum NS-Regime erklärt, warum er die Gefangenen, die größtenteils Gegner des NS-Regimes waren, wie Menschen behandelte. Durst durfte von seiner Frau und seinen Kindern im Lager besucht werden. Wegen einer Mittelohrentzündung und einer Augenerkrankung war Durst jeweils einen Monat lang im städtischen Krankenhaus Dieburg in Behandlung. Am 22. März 1945 erhielt Durst 6 Tage Freigang zum Besuch seiner Familie in Wuppertal. Ausgestattet mit einem Passierschein und Lebensmittelkarten für zwei Tage, verließ Durst das Lager und kehrte nicht mehr zurück. Man kann davon ausgehen, dass dies vom Lagerleiter Mohr auch so gewollt war.
Am 25. März 1945 wurde das Lager von den Amerikanern befreit.
Karl Durst wurde Haftentschädigung für 82 Monate und 10 Tage zuerkannt.
Karl Durst blieb in Wuppertal bei seiner Familie, wo er 1949 eine Schreinerwerkstatt eröffnete.
1947 wurde als drittes Kind die Tochter Erika geboren.
Gestorben am 16. April 1974 in Wuppertal.
